南京历史悠久，“六朝古都”。中华民国结束千年帝制，定都于此。民国政府自年开始在此兴建博物院，因日本侵华，抗战炮火阻断了博物馆兴建日程。
抗战结束之后，国民政府接续兴建之事。新中国成立之后，初步建成的“国立中央博物院”由新政府接管并进一步地修整兴建。
年，随着江苏行政区划整合，进一步对省内博物馆资源整合，将在苏州筹办的“江苏省博物馆”迁至南京，与当时已改名的“南京博物院”合并，组建省级博物馆——南京博物院。这是全国唯一一个以省会命名的省级博物馆。
南京博物院馆，馆藏丰富，有各类藏品43万余件（套）。年的时候，通过媒体，全民参与，选出了18件“镇馆之宝”。
这18件镇馆之宝，南京博物院为它们设有专门的镇馆之宝展厅。
一、西汉初金兽
年，出土于江苏省盱眙县南窑庄窖藏。通高10.2厘米，身长16厘米，身宽17.8厘米，重达克。是迄今我国出土文物中最大最重的金器。
二、明洪武釉里红岁寒三友纹梅瓶
年出土于南京，高41.7厘。是现存唯一完整的明洪武釉里红带盖梅瓶。
三、透雕人鸟兽玉饰件
年，出土于昆山市赵陵山遗址。玉饰件高5.5厘米、厚0.5厘米。系透闪石软玉制成，呈白色略带绿斑。属于良渚文化器物。
四、明金蝉玉叶
年，出土于苏州五峰山博士坞明朝张安晚家族墓中。一只金“蝉”立于一片八瓣”玉叶“之上。此物当为贵族女子的发簪。
五、青釉瓷神兽尊
年，出土于宜兴周处家族墓，是一件明器，高27.9厘米、口径13.3厘米。它是西晋青瓷工艺杰作。瓷尊底部刻有“东州”二字。
六、银缕玉衣
出土于年徐州土山一号汉墓中，全长厘米。由多块玉片组成，编缀玉衣的银丝重约克。东汉实行严格的玉衣丧葬制度，金缕玉衣为帝王专用，封王只能穿银缕玉衣。
七、人面兽面组合纹玉琮
年11月出土于常州武进寺墩遗址，是良渚文化琢玉工艺的代表之作。玉琮高7.2、边宽8.5～8.3、内孔径6.1厘米。造型为矮方柱体筒形，外方内圆。
八、明鎏金喇嘛塔
出土于南京牛首山弘觉寺地宫。这是一个“组合”文物，主体为一个鎏金佛塔，下面是一个须弥山形基座，基座四角还有四个青瓷罐。
九、徐渭《杂花图卷》
明代画家徐渭的代表作之一，纵30厘米，横.5厘米，在十米长卷中绘有牡丹、石榴、梅、兰、竹等共计13种花卉蔬果。是我国古代写意花鸟画集大成者的精绝之作。
十、错银铜牛灯
年出土于江苏邗江县甘泉2号东汉墓。通高46.2厘米，牛身长36.4厘米。由灯座、灯盏、烟管三部分组装而成，三部分均可拆卸，使用和擦洗很方便。当灯火点燃时，所产生的烟尘通过烟管导入灯座腹腔中的清水被溶解，从而确保室内空气的清新。
十一、明宣德青花寿山福海纹炉
炉高58厘米，口径37.6厘米，造型仿青铜鼎，景德镇官窑烧制。原藏于北京故宫，抗日战争爆发后，随大批文物南迁，辗转数十省，最终落身于当时南京的“国立中央博物院”。
十二、金观音菩萨立像
清代宫廷造办处制造，黄金制成，通高88厘米，佛身与莲座皆装饰华丽，嵌珍珠宝石。反映了乾隆时代强盛的国力。
十三、利玛窦《坤舆万国全图》
为明万历三十六年（）宫廷中的彩色摹绘本，是国内现存最早的、也是唯一的一幅据刻本摹绘的世界地图。乃清宫旧物，曾流落于琉璃厂，后被北平博物馆购得，抗日战争爆发后，随大批文物南迁，最终为“国立南京博物院”收藏。
十四、鎏金镶嵌兽形铜盒砚
年出土于徐州土山汉墓，长25厘米、宽14.8厘米、通高10.2厘米，通体鎏金并镶嵌红珊瑚、青金石、绿松石。盒盖与盒身以子母口相合。石质为甘肃临洮石。
十五、东汉广陵王玺金印
年发现于江苏邗江甘泉山。重.87克。印面长2.厘米、宽2.厘米。龟钮，钮高2.厘米，台高0.厘米。印文阴刻篆书“广陵王玺”，为东汉广陵王刘荆所用。
十六、沈寿绣品《耶稣像》
年，张謇后裔张绪武所献，是民国刺绣名家沈秀“仿真绣”的代表作。此件绣品，曾于年参加美国旧金山巴拿马世界博览会，获得一等大奖。
十七、错金银重络铜壶
年出土于盱眙南窑庄窖藏。又俗称“陈璋圆壶”，集先秦金属工艺之大成。由于长埋地下受二十斤重黄金挤压，有变形。上刻有铭文，反映了战国齐宣王攻燕战争。此器乃为齐国大胜所掠的燕国重器。
十八、竹林七贤砖画
年4月，出土于南京西善桥宫山北麓南朝帝王陵墓。原件分布在墓室中的南北两壁，各由近枚砖块拼嵌而成，规格均为长厘米，宽88厘米。两块砖画共计“八个人物”，包括魏晋时期的“竹林七贤”和春秋时的高士“荣启期”。所以此画全称“模印拼嵌画像砖《竹林七贤与荣启期》”